El IECS es una institución que creció a la par de la actividad de formación impulsada por el nacimiento y crecimiento de la Maestría en Efectividad Clínica. Hoy sostienen en conjunto una oferta variada de formación a través de cursos presenciales y a distancia, regulares e intensivos. 

El Departamento de Educación del IECS fue formalmente creado en el año 2013. Tiene como propósito principal el desarrollo y seguimiento de instancias de capacitación/formación en investigación clínica y sanitaria, gestión y evaluación de programas y políticas de salud. Organiza su tarea sobre la base de brindar acompañamiento y asesoramiento pedagógico a la propuesta formativa de la Maestría en Efectividad Clínica y de los distintos cursos que componen la oferta del IECS. Además, desarrolla actividades de formación de formadores, investigación y de cooperación técnica.